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Upgrading the taxonomic backbone of global freshwater animal biodiversity research infrastructures (infraFADA)

Projet de recherche IM/RT/23/infraFADA (Action de recherche IM)

Personnes :

  • Prof. dr.  MARTENS Koen - Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique (IRSNB)
    Partenaire financé belge
    Durée: 1/1/2023-31/12/2026

Description :

Dix pour cent de tous les animaux ne vivent que dans les eaux douces, alors que celles-ci couvrent moins d'un pour cent de la surface de la Terre. Cette disparité, où la biodiversité des eaux douces est supérieure d'un ou deux ordre(s) de grandeur à ce que l'on peut attendre de celle de la surface de la planète, est connue sous le nom de "paradoxe de l'eau douce". Cependant, les eaux douces ne sont pas seulement exceptionnellement riches en biodiversité, elles font également partie des écosystèmes les plus menacés au monde, notamment en raison de l'impact de l'homme et du changement climatique qui en résulte.

Plusieurs infrastructures de recherche virtuelles, telles que le GBIF « Global Biodiversity Information Facility », documentent et répertorient la biodiversité existante des eaux douces. Toutefois, ces référentiels de données mondiaux nécessitent des bases de données taxonomiques fiables, condition sine qua non pour les rendre interopérables. Actuellement, la base données FADA « Freshwater Animal Diversity Assessment » comprend un vaste ensemble de listes mondiales de taxons pour les groupes d'animaux d'eau douce (125 530 espèces décrites et 11 388 genres). Toutefois, la taxonomie est une discipline scientifique vivante au sein de laquelle de nouveaux taxons sont décrits alors que d’autres déjà existants migrent vers de nouvelles positions taxonomiques. Par conséquent, après une décennie et demie de relative inactivité, FADA doit être mis à jour, tant sur le plan technique qu'en ce qui concerne son contenu. Une fois actualisée, FADA pourra alors servir de pilier taxonomique dans des répertoires de biodiversité pour les animaux d'eau douce.
InfraFADA est un projet de trois ans développé dans le cadre de l'appel « INFRA-FED ». Il transformera la base de données initiale de FADA en une infrastructure qui permettra d'améliorer la recherche et la compréhension de la biodiversité des eaux douces. Notamment en développant, en utilisant et en mettant en œuvre des méthodes nouvelles et innovantes. Afin d'atteindre ces objectifs, infraFADA a développé cinq objectifs.
Le premier objectif est de reconstituer un nouveau consortium d'experts taxonomiques pour FADA. Plusieurs experts du précédent consortium ont déjà confirmé qu'ils étaient prêts à poursuivre leur travail et leur collaboration à ce projet. D’’autres ont entre-temps pris leur retraite ou ont pris d'autres engagements, ces experts devront donc être remplacés. L’Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique (IRSNB) coordonnera la reconstitution du consortium d'experts. Les experts seront invités à mettre à jour la liste des taxons pour leur groupe d'animaux aquatiques, qui sera ensuite introduite dans la base de données FADA.

Deuxièmement, le projet infraFADA développera un système en ligne de gestion des informations sur les taxons (FADAtims) qui permettra aux experts FADA de conserver, maintenir et publier leurs listes de taxons. Ce système rendra ces listes accessibles à tous les utilisateurs potentiellement intéressés et interopérables avec d'autres infrastructures de données (mondiales). Ce travail sera effectué par le sous-traitant BOKU (Vienne), en collaboration avec la société Kartoza et l'institut de coordination IRSNB. Dès que FADAtims sera opérationnel, les experts FADA pourront saisir de nouveaux taxons et/ou insérer de nouvelles décisions taxonomiques pour leur groupe sur une base ad hoc et sans autre intervention technique.

Le troisième objectif s'appuie sur les deux précédents et reliera les listes de taxons FADA aux infrastructures de recherche internationales telles que le GBIF, le CoL et le FIP, en les utilisant comme piliers taxonomiques. Le projet a également pour ambition de réévaluer les connexions précédemment prévues entre les données FADA et Aphia/WORMS, en suivant le protocole développé dans le cadre du projet AQUARES de Belspo. De plus, infraFADA contactera d'autres initiatives et réseaux internationaux traitant des données taxonomiques sur les eaux douces, et vérifiera si les listes de taxons FADA peuvent leur être utiles. Il s'agira par exemple de DISSCo, de l'UICN, d'eBIOAtlas et de diverses initiatives au sein du consortium LifeWatch, ainsi que d’autres projets de recherche en cours et à venir.

L'objectif 4 concerne la publication des données FADA. Nous envisageons de publier des listes de taxons de référence, y compris des analyses, dans des revues scientifiques et dans le Freshwater Metadata Journal. Nous impliquerons également la communauté des experts en taxonomie du FADA dans la publication d'une mise à jour du volume hautement cité de FADA Hydrobiologia 2008 (dont le chapitre de conclusion a, lui seul, été cité 660 fois dans Google Scholar).

Le dernier objectif concerne les activités de sensibilisation destinées à divers utilisateurs, telles que les organisations menant des activités de surveillance et de contrôle dans le cadre de la Water Framework Directive (WFD), mais également destinées au grand public. Cela se fera en premier lieu par la publication des listes de taxons sur le site web FADA et sur ChecklistBank, ainsi que par le biais des réseaux sociaux, du populaire blog du FIP sur l'eau douce et de nouvelles sur d'autres sites web (SIL, CETAF, SEFS, ...). InfraFADA organisera également un événement de fin de projet, associée à une autre conférence internationale ou à un symposium, au cours duquel plusieurs activités de sensibilisation seront organisées à l'intention du grand public.
Ces objectifs seront mis en œuvre via un ensemble de 6 modules de travail et de 19 tâches.

La gestion d'infraFADA sera centralisée à l’IRSNB, mais le suivi de l’exécution des différentes tâches et des résultats attendus, se fera par l'intermédiaire d'un comité de pilotage (Steering Committee, SC). Ce comité sera composé des PI de l'institut coordinateur et du sous-traitant, du manager de projet et d'un représentant du consortium d'experts FADA. Le comité de suivi (Follow-up Committee) sera lui composé de plusieurs représentants d'organisations liées au projet et disposera d'une importante expérience en matière d'application et de gestion des données sur la biodiversité, ce qui sera très utile pour optimiser les objectifs et les avancées d’infraFADA. Des réunions régulières (annuelles et ad hoc si nécessaire) du comité de pilotage et du comité de suivi seront organisées pour permettre des flux d'information bilatéraux.

La pertinence de l'infrastructure de recherche FADA ressort clairement des descriptions ci-dessus : il existe un besoin évident d'informations taxonomiques actualisées sur la biodiversité des eaux douces pour toute une série d'utilisateurs potentiels, tels que les référentiels de données mondiaux et les parties liées à la Water Framework Directive, pour ne citer que ceux qui sont les plus évidents. Les liens prévus avec des initiatives internationales telles que GBIF, CoL, FIP et d'autres assurent l'ancrage international de FADA. L'impact potentiel d'infraFADA se situe donc dans l'accroissement des connaissances scientifiques, le contrôle de la qualité taxonomique des bases de données numériques sur la biodiversité et les contributions qui en résultent pour l'interface science-politique dans le domaine de la biodiversité des eaux douces.