Le 4 mars 2005, le Conseil des Ministres a approuvé le nouveau programme "La science pour un développement durable" (2005-2009). Ce programme fait suite aux deux programmes précédents PADD I et II (premier (1996-2001) et second (2000-2005) Plans d’appui scientifique à une politique de développement durable). Par ailleurs, le programme SSD a intégré les nouvelles thématiques "Santé et environnement" et "normalisation". Le 9 juillet 2010, le Conseil des Ministres a autorisé la prolongation du programme pour 2010.
Le programme SSD couvre les 8 thématiques de recherche prioritaires suivantes : Energie, Transport et mobilité, Agro-alimentaire, Santé et environnement, Climat (dont Antarctique), Biodiversité (dont Antarctique et mer du Nord), Atmosphère et écosystèmes terrestres (y compris eaux douces) et marins (dont Antarctique et mer du Nord) et Recherches transversales.
Actuellement, 115 réseaux de recherche sont financés dont 10 clusters pour un total de 70 M€.