Chaque année, la Politique scientifique fédérale donne des subsides représentant l'intervention de la Belgique à diverses institutions, publiques ou privées, belges ou étrangères liées à l'enseignement. Vu la nature et les missions nationales ou internationales de ces institutions, les subventions ou crédits sont restés à charge du budget fédéral.
Institutions fédérales partenaires et autres organismes subsidiés:
Justice
> Institut national de Criminalistique et de Criminologie
> Centre pénitentiaire de recherche et d’observation clinique
Santé publique
> Sciensano
> Centre Fédéral d'Expertise des Soins de Santé (KCE)