Elk jaar geeft het Federaal Wetenschapsbeleid subsidies - dit is de bijdrage van België - aan diverse openbare of particuliere Belgische of buitenlandse instellingen die met onderwijs te maken hebben. Vanwege de aard en de nationale of internationale roeping van deze instellingen, bleven de subsidies of kredieten ten laste van de federale begroting.
Federale partnerinstellingen en andere gesubsidieerde organisaties:
Justitie
> Nationaal Instituut voor Criminalistiek en Criminologie 
> Penitentiair Onderzoeks- en Klinisch Observatiecentrum
Landsverdediging
> Koninklijk Museum van het Leger en de Krijgsgeschiedenis
Volksgezondheid
> Sciensano
> Federaal Kenniscentrum voor de Gezondheidszorg (KCE)
